İnsan Mikrobiyomu dersinin amacı insan mikrobiyomunun bileşimi, işlevsel önemi ve insan sağlığı ve hastalığı ile olan karmaşık ilişkisini kapsayan kapsamlı bir anlayış sağlamaktır.
Dersin İçeriği
Bu ders; Mikrobiyom araştırmalarında tarihsel perspektif ve kilometre taşları,Sağlık ve hastalıkta insan mikrobiyomunun önemi,Taksonomik ve fonksiyonel profillemenin anlaşılması ve mikrobiyal topluluk analizi için tekniklerin özeti,Metagenomik ve Metatranskriptomik analizler,Mikrobiyom ve İnsan Hastalıkları (Mikrobiyomun bulaşıcı ve kronik hastalıklardaki rolü); konularını içermektedir.
Dersin Öğrenme Kazanımları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1. Bileşimi, çeşitliliği ve mikrobiyal topluluklar ile insan konakçı arasındaki dinamik etkileşimlerini açıklar
2. Mikrobiyal toplulukları taksonomik ve işlevsel düzeyde analiz etmek için metagenomik ve metatranskriptomik gibi teknikleri kullanarak mikrobiyom verilerinin değerlendirilmesi ve yorumlanmasında ileri analitik beceriler geliştirir
3. Mikrobiyomun bulaşıcı hastalıklardan kronik durumlara kadar insan hastalıklarındaki rolünü keşfetmek ve mikrobiyal toplulukların sağlığı etkileme ve hastalık durumlarına katkıda bulunma mekanizmalarını açıklar
4. Karmaşık mikrobiyal ekosistemleri incelemek için çoklu omik verileri entegre etme konusunda yetkinlik kazanmak ve mikrobiyomun işlevsel yönlerini çözmede omik yaklaşımlarını açıklar
Öğretim Yöntemleri:
Ölçme Yöntemleri:
Ders Akışı
Sıra
Konular
Ön Hazırlık
1
Mikrobiyom araştırmalarında tarihsel perspektif ve kilometre taşları
2
Sağlık ve hastalıkta insan mikrobiyomunun önemi
3
Taksonomik ve fonksiyonel profillemenin anlaşılması ve mikrobiyal topluluk analizi için tekniklerin özeti
4
Metagenomik ve Metatranskriptomik analizler
5
Mikrobiyom ve İnsan Hastalıkları (Mikrobiyomun bulaşıcı ve kronik hastalıklardaki rolü)
Kaynak
1. Bioinformatic and Statistical Analysis of Microbiome Data: From Raw Sequences to Advanced Modeling with Qiime 2 and R,
2. Human-Gut Microbiome, Gunjan Goel, Teresa Requena, Saurabh Bansal ( ISBN: 9780323913133)
3. Bilimsel makaleler
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
No
Program Yeterliliği
Katkı Düzeyi
1
2
3
4
5
1
Bilimsel araştırmaların planlanması ve istatistiksel değerlendirmesini yapar, sonuçlarını hakemli bir dergide yayinlamak uzere makale hazirlar ve/veya bilimsel bir toplantıda sunar.
2
Tıbbi Mikrobiyoloji alanında kullanılan laboratuvar yöntemlerini bilir ve mikroorganizmalarla ilgili deneysel calisma tasarimi yapar.
3
Mikrobiyoloji alanında yüksek düzeyde güncel bilimsel bilgi ve beceri kazanır ve alanındaki yenilikleri takip eder.
X
4
Uygulamalı temel mikrobiyoloji laboratuvarında rutin ve araştırma amacına hizmet eden cihaz ve aletlerin kullanımını bilir
5
Bilimsel çalışma sonuçlarını uzmanlik düzeyinde istatistiksel analizlerini yapma, degerlendirme, savunma ve yazili ya da sozlu sunma yetenekleri geliştirir.
X
6
Bilimsel proje yazma yetkinligi gelistirir.
7
Bilimsel ve teknik bir sorunu çözer.
X
8
Tıbbi Mikrobiyoloji alanı ile ilgili toplantılara katılır, bildiri sunar, tartışmalara katılır, seminerler verir
9
Mikrobiyal hastalıkları ve etiyolojisini uzmanlık düzeyinde anlar ve yorumlar.
X
Değerlendirme Sistemi
Katkı Düzeyi
Mutlak Değerlendirme
Ara Sınavın Başarıya Oranı
50
Genel Sınavın Başarıya Oranı
50
Toplam
100
AKTS / İşyükü Tablosu
Etkinlik
Sayı
Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Saati
15
2
30
Rehberli Problem Çözme
15
6
90
Problem Çözümü / Ödev / Proje / Rapor Tanzimi
4
50
200
Okul Dışı Diğer Faaliyetler
0
0
0
Proje Sunumu / Seminer
1
50
50
Kısa Sınav (QUİZ) ve Hazırlığı
0
0
0
Ara Sınav ve Hazırlığı
1
30
30
Genel Sınav ve Hazırlığı
1
50
50
Performans Görevi, Bakım Planı
0
0
0
Toplam İş Yükü (Saat)
450
Dersin AKTS Kredisi = Toplam İş Yükü (Saat)/30*=(450/30)
15
Dersin AKTS Kredisi: *30 saatlik çalışma 1 AKTS kredisi sayılmaktadır.
Dersin Detaylı Bilgileri
Ders Tanımı
Ders
Kodu
Yarıyıl
T+U Saat
Kredi
AKTS
İNSAN MİKROBİYOMU
MKBD2131370
Güz Dönemi
2+0
2
15
Ders Programı
Ön Koşul Dersleri
Önerilen Seçmeli Dersler
Dersin Dili
Türkçe
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Türü
Programa Bağlı Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Prof.Dr. Süleyman YILDIRIM
Dersi Verenler
Prof.Dr. Süleyman YILDIRIM
Dersin Yardımcıları
Dersin Amacı
İnsan Mikrobiyomu dersinin amacı insan mikrobiyomunun bileşimi, işlevsel önemi ve insan sağlığı ve hastalığı ile olan karmaşık ilişkisini kapsayan kapsamlı bir anlayış sağlamaktır.
Dersin İçeriği
Bu ders; Mikrobiyom araştırmalarında tarihsel perspektif ve kilometre taşları,Sağlık ve hastalıkta insan mikrobiyomunun önemi,Taksonomik ve fonksiyonel profillemenin anlaşılması ve mikrobiyal topluluk analizi için tekniklerin özeti,Metagenomik ve Metatranskriptomik analizler,Mikrobiyom ve İnsan Hastalıkları (Mikrobiyomun bulaşıcı ve kronik hastalıklardaki rolü); konularını içermektedir.
Dersin Öğrenme Kazanımları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
1. Bileşimi, çeşitliliği ve mikrobiyal topluluklar ile insan konakçı arasındaki dinamik etkileşimlerini açıklar
2. Mikrobiyal toplulukları taksonomik ve işlevsel düzeyde analiz etmek için metagenomik ve metatranskriptomik gibi teknikleri kullanarak mikrobiyom verilerinin değerlendirilmesi ve yorumlanmasında ileri analitik beceriler geliştirir
3. Mikrobiyomun bulaşıcı hastalıklardan kronik durumlara kadar insan hastalıklarındaki rolünü keşfetmek ve mikrobiyal toplulukların sağlığı etkileme ve hastalık durumlarına katkıda bulunma mekanizmalarını açıklar
4. Karmaşık mikrobiyal ekosistemleri incelemek için çoklu omik verileri entegre etme konusunda yetkinlik kazanmak ve mikrobiyomun işlevsel yönlerini çözmede omik yaklaşımlarını açıklar
Öğretim Yöntemleri:
Ölçme Yöntemleri:
Ders Akışı
Sıra
Konular
Ön Hazırlık
1
Mikrobiyom araştırmalarında tarihsel perspektif ve kilometre taşları
2
Sağlık ve hastalıkta insan mikrobiyomunun önemi
3
Taksonomik ve fonksiyonel profillemenin anlaşılması ve mikrobiyal topluluk analizi için tekniklerin özeti
4
Metagenomik ve Metatranskriptomik analizler
5
Mikrobiyom ve İnsan Hastalıkları (Mikrobiyomun bulaşıcı ve kronik hastalıklardaki rolü)
Kaynak
1. Bioinformatic and Statistical Analysis of Microbiome Data: From Raw Sequences to Advanced Modeling with Qiime 2 and R,
2. Human-Gut Microbiome, Gunjan Goel, Teresa Requena, Saurabh Bansal ( ISBN: 9780323913133)
3. Bilimsel makaleler
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
No
Program Yeterliliği
Katkı Düzeyi
1
2
3
4
5
1
Bilimsel araştırmaların planlanması ve istatistiksel değerlendirmesini yapar, sonuçlarını hakemli bir dergide yayinlamak uzere makale hazirlar ve/veya bilimsel bir toplantıda sunar.
2
Tıbbi Mikrobiyoloji alanında kullanılan laboratuvar yöntemlerini bilir ve mikroorganizmalarla ilgili deneysel calisma tasarimi yapar.
3
Mikrobiyoloji alanında yüksek düzeyde güncel bilimsel bilgi ve beceri kazanır ve alanındaki yenilikleri takip eder.
X
4
Uygulamalı temel mikrobiyoloji laboratuvarında rutin ve araştırma amacına hizmet eden cihaz ve aletlerin kullanımını bilir
5
Bilimsel çalışma sonuçlarını uzmanlik düzeyinde istatistiksel analizlerini yapma, degerlendirme, savunma ve yazili ya da sozlu sunma yetenekleri geliştirir.
X
6
Bilimsel proje yazma yetkinligi gelistirir.
7
Bilimsel ve teknik bir sorunu çözer.
X
8
Tıbbi Mikrobiyoloji alanı ile ilgili toplantılara katılır, bildiri sunar, tartışmalara katılır, seminerler verir
9
Mikrobiyal hastalıkları ve etiyolojisini uzmanlık düzeyinde anlar ve yorumlar.